Otkrivanje koronavirusa u otpadnim vodama

Epidemiologija zasnovana na otpadnim vodama (engl. wastewater-based epidemiology, WBE) predstavlja analizu otpadnih voda radi utvrđivanja prisutnosti bioloških ili kemijskih sredstava u svrhu praćenja javnog zdravlja. Ovakav pristup se ranije koristio za otkrivanje prisutnosti farmaceutskog ili industrijskog otpada, lijekova, virusa i potencijalne pojave bakterija otpornih na antibiotike. Nedavna istraživanja pokazala su da otkrivanje koronavirusa SARS-CoV-2 u otpadnim vodama može pomoći u praćenju izbijanja epidemije COVID-19. Testiranje otpadnih voda na RNA iz SARS-CoV-2, provodi se već u nekoliko zemalja uključujući i neke od država članica Europske unije kao što su na primjer Italija, Nizozemska, Mađarska, Španjolska i Francuska.

Virus SARS-CoV-2, koji uzrokuje COVID-19, može se izlučiti iz organizma kroz feces osoba oboljelih s COVID-19, ali i druge tjelesne izlučevine koje završavaju u otpadnim vodama. Kako se SARS-CoV-2 može izbaciti kroz feces osoba sa simptomatskom ili asimptomatskom infekcijom, nadzorom otpadnih voda se mogu prikupiti podaci o obje vrste infekcije.

Iako se epidemiologijom zasnovanom na otpadnim vodama ne može utvrditi koje su osobe zaražene, ipak ona ima nekoliko prednosti u usporedbi s ispitivanjem pacijenta. Tako se na primjer RNA SARS-CoV-2 može otkriti u ljudskom izmetu nekoliko dana do tjedan dana prije pojave simptoma. Do sada su objavljena znanstvena istraživanja pokazala da nadzor otpadnih voda može predvidjeti izbijanje COVID-19 čak i prije pojedinačnog testiranja pacijenta i prijema u bolnicu. Na ovakav način se testiranje otpadnih voda može koristiti kao alat za rano upozorenje. Jedan uzorak otpadne vode može pružiti podatke o prosječnoj stopi zaraze tisuća ljudi. Stoga dobiveni skupni podaci mogu biti posebno informativni za područja s niskim kliničkim stopama testiranja na COVID-19. Umjesto pojedinačnog testiranja tisuća pacijenata, prikupljanje i ispitivanje malog broja uzoraka otpadnih voda mnogo je isplativije za dobivanje podataka o cijeloj populaciji. Kontinuirano praćenje otpadnih voda može se koristiti za utvrđivanje trendova trenutnih izbijanja, prepoznavanje novih izbijanja i prevalenciju infekcija.

Podaci ispitivanja otpadnih voda s Centralnog uređaja za pročišćavanja otpadnih voda grada Zagreba koji će se prikupiti kroz projekt namijenjeni su kao nadopuna postojećih nadzornih sustava COVID-19, i pomoći epidemiolozima da bolje razumiju opseg infekcije COVID-19 na području grada Zagreba i okolice koji predstavlja gotovo četvrtinu ukupnog stanovništva RH.

Početak uzorkovanja i uspostava metode detekcije i kvantifikacije SARS-CoV-2 u otpadnim vodama planiran je za kraj studenoga i početak prosinca. Prva opsežnija uzorkovanja planirana su od polovice prosinca, a prvi rezultati očekuju se krajem prosinca odnosno početkom siječnja.