Rezultati SARS-CoV-2 (Covid-19) sekvenciranja HZJZ-a

Zbog provođenja nadzora nad širenjem virusa i praćenja varijanti, pozitivni uzorci se zatim sekvenciraju u HZJZ-u.

Genomski nadzor treba pratiti preporuke Europskog centra za sprečavanje i kontrolu bolesti ECDC za reprezentativno uzorkovanje.

Rezultati sekvenciranja SARS-COV-2 uzoraka prijavljuju se ECDC-u i unose u internacionalnu bazu podataka (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data - GISAID2).

Svjetska zdravstvena organizacija (WHO) prati određene Omikron podvarijante.

Varijante od interesa (variants of concern - VOC) su one čije promjene u genomu utječu na kliničku sliku, izbjegavanje imunog odgovora i širenje virusa.

Trenutno WHO ne prati niti jednu VOC varijantu.

Varijante od interesa (variants of interest - VOI) su one varijante koje imaju genetske promjene za koje se zna da bi mogle utjecati na kliničku sliku, izbjegavanje imunog odgovora i širenje virusa.

Varijante pod nadzorom (variants under monitoring - VUM) su one koje imaju promjene u genomu za koje se sumnja da nose povećan rizik i koje bi mogle negativno utjecati na epidemiološku sliku.

U razdoblju od 14.05.2023. do 17.09.2023. ukupno su sekvencirana 373 uzorka.

U tom razdoblju najzastupljenija je bila XBB.1.9.1 varijanta s 82 uzorka, što čini gotovo 22% ukupno sekvenciranih uzoraka.

Varijanta XBB.1.5 u promatranom razdoblju između 14.08.2023. do 10.09.2023 nakon dugo vremena nije više najzastupljenija, već je to XBB.1.16 s 39 uzoraka, odnosno 28,7% u ukupnom udjelu sekvenciranih uzoraka (136 uzoraka).